L'alliance de la génomique, de la protéomique et de la bioinformatique dessine les contours d'une médecine innovante qui fera passer progressivement la prise en charge des cancers, du “prêt-à-porter” actuel vers le “sur mesure”.

Bioinformatique

Regroupant les compétences d'ingénieurs, de physiciens et de mathématiciens, la plateforme de bioinformatique de l'Institut Curie permet l'analyse des données cliniques (issues des dossiers médicaux et de la tumorothèque) et biologiques (fournies par les puces). La bioinformatique offre aux chercheurs et aux médecins les outils informatiques indispensables pour traiter, organiser et présenter visuellement les données de plus en plus nombreuses dont ils disposent.

Criblage cellulaire à haut débit

La Plateforme Biophenics de criblage cellulaire automatisée et à haut débit utilise des algorithmes d’analyse d’images pour quantifier, au niveau cellulaire, les effets de la perturbation de l’expression de certains gènes. Cette technologie permet d’identifier des cibles moléculaires pour la recherche pharmacologique et des médicaments candidats susceptibles d’être plus efficaces contre les cancers et moins toxiques pour l’organisme.

Chimiothèque

La banque de composés chimiques de l'Institut Curie-CNRS est le fruit de 60 années de synthèse de composés à visée médicinale. Ces substances sont des produits intermédiaires divers ou finaux obtenus au cours des programmes d’optimisation contre différentes cibles thérapeutiques.

Cytométrie - Analyse et tri cellulaires

La cytométrie en flux permet de mesurer la fluorescence ou la lumière diffractée d'un grand nombre de particules à haute vitesse telles que des cellules, billes, bactéries, levures ou organites. À l'Institut Curie, la cytométrie en flux est principalement utilisée pour quantifier de multiples marqueurs sur des cellules avec la possibilité de trier simultanément plusieurs sous-populations d'intérêt.

Expérimentation in vivo et investigation pré-clinique

• L’expérimentation in vivo, complémentaire à l’expérimentation in vitro (en laboratoire), est souvent rendue nécessaire pour identifier de nouvelles cibles cancéreuses et imaginer des modalités thérapeutiques.

• Le Laboratoire d’investigation pré-clinique a pour mission du d’évaluer l’efficacité de traitements anti-cancéreux innovants et sélectionne les meilleurs d’entre eux avant d’être l’objet d’essais cliniques. Complémentaires aux criblages réalisés par l’industrie pharmaceutique, ces recherches permettent d’optimiser les effets de médicaments potentiels et de prédire leurs effets d’association thérapeutiques.

Génomique

• Des équipements de génomique et d’analyse cytogénétique tels CGH-array, SNP-array, biopuces à haute densité… sont utilisés pour rechercher un profil d'anomalies spécifiques de tumeurs, en complément du développement d’outils bioinformatiques spécifiques.

• La Plateforme Affymetrix de biologie moléculaire utilise des puces à ADN pour analyser l'expression des gènes dans une cellule donnée. Ces données, comparées à celles issues de cellules normales, permettent de mieux classer et diagnostiquer les cancers et ainsi de prévoir plus précisément leur réponse au traitement.

• La Plateforme de séquençage de haut débit installée en 2009 est capable de séquencer l’équivalent d’un génome humain par semaine. Identifier les variations simples de séquences génétiques ou les remaniements chromosomiques plus complexes de nature constitutive ou tumorale, cartographier les zones de fixation protéiques ou de modification de la chromatine, ou encore identifier les petits ARN régulateurs sont les finalités premières de cette plateforme ouvertes aux chercheurs d’autres institutions de recherche.

Imagerie scientifique

La plateforme d’Imagerie cellulaire, tissulaire et moléculaire mutualise plusieurs plateaux techniques et plateformes technologiques qui proposent des formations à l'utilisation des équipements sophistiqués et des initiations aux savoir-faire en imagerie cellulaire et moléculaire. Des microscopes de pointe couplés à des ordinateurs sont ainsi à disposition des chercheurs de l’Institut Curie tandis que l'usage de certains équipements est ouvert aux chercheurs d’autres centres de recherche.

Protéomique

• La Plateforme de puces protéiques en phase reverse (RPPA) utilise la technologie innovante RPPA qui consiste à déposer à l'aide d'un robot des échantillons biologiques en très faible quantité pour analyser les protéines avec des anticorps très spécifiques. Dotée d’une gamme de plus de 120 anticorps, la plate-forme de puces protéiques en phase reverse permet d’étudier la plupart des voies de signalisation cellulaire connues à ce jour.

• Le Laboratoire de spectrométrie de masse protéomique est impliqué dans de nombreux projets pour l'étude du protéome. Son rôle est d'identifier et/ou caractériser les protéines d'intérêts ainsi que les modifications post-traductionnelles et ceci par spectrométrie de masse après séparation par SDS PAGE, gels 2D et chromatographie liquide.