Data Analyst – IR (H/F)

Date de clôture
Lieu(x) de travail
Paris
Secteur
Centre de Recherche
CDD
Le Centre de recherche de l’Institut Curie
L'Institut Curie est un acteur majeur de la recherche et de la lutte contre le cancer. Il est constitué d'un hôpital et d'un Centre de recherche de plus de 1000 collaborateurs avec une forte représentativité internationale.
L’objectif du Centre de recherche de l’institut Curie est de développer la recherche fondamentale et d’utiliser les connaissances produites pour améliorer le diagnostic, le pronostic, la thérapeutique des cancers dans le cadre du continuum entre la recherche fondamentale et l’innovation au service du malade.

Description du poste

Laboratoire - Service

Un poste d'ingénieur de recherche (IR) de 3 ans est disponible pour l'étude de données multi-omiques single-cell pour des échantillons de cancer du sein. Nous souhaitons caractériser le paysage moléculaire (génomique, transcriptomique et épigénomique) des cancers du sein triple négatif en réponse aux chimiothérapies. Nous étudions des échantillons de tumeurs mammaires, et également des PDX (patient-derived xenografts) et lignées cellulaires.

Le/la candidat(e) retenu(e) travaillera au sein du groupe DEpiC (https://institut-curie.org/team/vallot dirigé par Céline Vallot) dans le département translationnel de l'Institut Curie avec des biologistes d'autres bioinformaticiens. Le laboratoire Vallot est expert en analyse épigénomique single-cell et a développé des ressources expérimentales (Grosselin Nature Genetics 2019 ; Marsolier & Prompsy Nature Genetics 2022) et computationnelles (voir https://github.com/vallotlab, et Prompsy Nature Communications 2020 par exemple) pour cartographier les épigénomes cellule par cellule dans les tumeurs. L'Institut Curie propose des plateformes et des plateformes de pointe dans un environnement hautement dynamique et international.

 

Missions

  • Conduire l’analyse de données single-cell epigenomic & transcriptomic sur des cohortes d’échantillons de patients ou de données issues de modèle d’étude du laboratoire, depuis l’analyse des données brutes jusqu’à l’interprétation fine des données (identification des populations cellulaires, marqueurs, analyses de voies de signalisation, réseaux de régulation, …)
  • Développer des algorithms/packages ad hoc pour des tâches particulières d’analyse
  • Collaborer avec les biologistes de l’équipe pour transformer des données single-cell complexes en connaissances/hypothèses biologiques.

 

Profil recherché

Formation et expérience 

  • Diplômé en Data Science, Bioinformatique ou Statistiques / Mathématiques (M2 ou équivalent, école d’Ingénieur)
  • Formation ou expérience dans l’analyse de données de séquençage à haut débit, idéalement single-cell (pas obligatoire)
  • Notions de biologie sur la régulation des gènes serait un plus.

Compétences et qualités requises

  • Anglais
  • R & Python
  • Travail en autonomie et en collaboration avec les bio-informaticiens et biologistes de l’équipe
  • Présentations orales (Anglais) à l’équipe, l’unité et lors de conférences.

 

Toutes nos opportunités sont ouvertes à des personnes en situation de handicap.

 

Informations sur le contrat

  • Type de contrat : CDD
  • Date de démarrage : dès que possible
  • Durée du contrat : 3 ans (1 an renouvelable)
  • Temps de travail : Temps complet
  • Rémunération : selon les grilles en vigueur
  • Avantages : Restauration collective, prise en charge du titre de transport annuel à 70%, mutuelle d’entreprise
  • Localisation du poste : Paris
  • Référence : 2022-09-UMR3244-DATA01

 

Contact

Pour postuler, merci d’envoyer CV et lettre de motivation à celine.vallot@curie.fr.

 

Date de parution de l’offre : Septembre 2022

Date limite des candidatures : Octobre 2022

 

L'Institut Curie est un employeur inclusif respectant l'égalité des chances.

Il s’engage également à appliquer des normes exigeantes en matière d'intégrité de la recherche.

Exemple : +33112365489
Seuls les PDF sont acceptés.