Ingénieur de Recherche en Cryo-microscopie électronique (H/F)

Description du poste

Laboratoire

Le Centre d’Imagerie Multimodale (CNRS UAR2016, Inserm US43, Université Paris-Saclay et Institut Curie), situé dans les locaux de l’Institut Curie à Orsay (91), regroupe des activités de service et de développement en microscopie photonique, en microscopie électronique, en microscopie ionique et en traitement et analyse d’images. Cette Unité d’Appui et de Recherche emploie entre 10 et 13 personnes, dont 6 statutaires de 4 tutelles différentes, réparties dans ses 4 pôles d’activités (https://curie.fr/plateforme/curiecoretech-centre-dimagerie-multimodale-uar2016-us43).

Placée sous la responsabilité hiérarchique du directeur d’unité, la personne recrutée sera en charge du pôle de cryo-microscopie électronique, ce qui implique des activités de management de plate-forme (suivi des équipements, gestion budgétaire, formation des utilisateurs, opération des instruments dont le cryo-microscope JEOL JEM-2200FS), de développement méthodologique et/ou technologique et de recherche en participant à divers projets scientifiques. Un premier projet prioritaire consistera à étudier les effets des modifications post-traductionnelles de la tubuline sur l’architecture de la paroi des microtubules (Equipe du Dr. Carsten Janke : https://curie.fr/equipe/janke).

Les personnes sur le point de soutenir leur thèse ou ayant accompli une courte mission post-doctorale sont tout particulièrement encouragées à soumettre leur candidature. Des formations seront proposées pour parfaire les compétences du (ou de la) lauréat(e).

Activités principales

De façon spécifique en qualité de spécialiste de la cryo-microscopie électronique moléculaire et cellulaire, la personne retenue interviendra dans les domaines suivants :

• Au sein du Centre d’Imagerie Multimodale – UAR2016 - US43, opération d'un cryo-microscope électronique JEOL JEM-2200FS, équipé d’un filtre d’énergie et d’une caméra à détection directe des électrons, principalement en mode TEM (2D et séries tiltées pour la tomographie), pour l'imagerie d’objets biologiques dans le but d’en déterminer leur architecture et/ou leur structure à haute résolution, en fonction des collaborations et contrats de recherche. Applications possibles en modes STEM, EELS et EFTEM.
• Réglage du microscope électronique en fonction des expériences et participation aux opérations de maintenance, en coordination avec le constructeur du microscope.
• Développement et mise en œuvre d'approches originales de microscopie, notamment corrélatives avec d’autres modes d’imagerie, dont la microscopie ionique et la microscopie photonique, en fonction des collaborations et contrats de recherche.
• Préparation d’échantillons congelés-hydratés pour la cryo-microscopie et en coloration négative.
• Collecte, traitement et analyse des données en utilisant des logiciels dédiés.

De façon générale, en qualité de Manager de plate-forme :

• Etudier les besoins scientifiques à chaque projet, proposer les techniques de caractérisation ou d’observations adaptées.
• Analyser les contraintes et concevoir ou faire évoluer la chaîne d’expérimentation en fonction de chaque projet.
• Organiser le suivi de la réalisation, valider et qualifier le dispositif ou la méthode à ses différentes étapes
• Réaliser ou piloter l’acquisition et l’analyse des données, les interpréter et les valider.
• Former et informer sur les principes et la mise en œuvre du cryo-microscope électronique et de ses accessoires, et assurer la sécurité du fonctionnement.
• Gérer l’ensemble des ressources humaines, techniques et financières allouées aux expériences
• Conseiller dans son domaine d’expertise.
• Etablir des devis pour évaluer les prestations requises selon les projets adressés à la plate-forme.
• Participer à la rédaction de dossiers dans le cadre des demandes de financement.
• Encadrement et formation d’étudiants et de nouveaux utilisateurs.
• Assurer une veille scientifique et technologique.

• Assurer un suivi des équipements (petite maintenance).
• Présenter, diffuser et valoriser les réalisations.

Profil recherché

Connaissances

• Connaissances générales en techniques et sciences de l’ingénieur, en particulier en optique et, de façon générale, en physique des méthodes d'imagerie.
• Connaissances générales en Biologie, en Biochimie et en Biophysique.
• Connaissances approfondies du secteur de la cryo-microscopie électronique.
• Connaissances approfondies des outils informatiques du domaine.
• Connaissance de l’environnement et réseaux professionnels.
• Maîtrise de la présentation écrite et orale.
• Langue anglaise : B1 à B2 (cadre européen commun de référence pour les langues).

Compétences opérationnelles

• Mettre en œuvre en spécialiste les approches de cryo-microscopie électronique, depuis la préparation des échantillons (échantillons congelés-hydratés en priorité, mais éventuellement aussi coloration négative, inclusion en résine et ultramicrotomie), le réglage du microscope jusqu’à l’acquisition des données selon les différentes modalités (cryo-TEM et cryo-tomographie en priorité ; mais aussi possiblement EELS, EFTEM et STEM), ainsi que leur traitement et leur analyse.
• Piloter un projet méthodologique en collaboration avec les chercheurs utilisateurs de la plate-forme.
• Utiliser les logiciels spécifiques au domaine.
• Encadrer du personnel technique et des stagiaires.
• Animer une réunion.
• Conduire une négociation.
• Appliquer les procédures d’assurance qualité.
• Appliquer les règles d’hygiène et de sécurité.
• Gérer un budget.
• Appliquer la règlementation des marchés publics.
• Assurer une veille technique, technologique et scientifique.

Compétences comportementales

• Capacité de conceptualisation.
• Sens critique.
• Sens de l’organisation, de l’autonomie et des priorités.
• Capacité à travailler en équipe et à rendre compte.
• Capacité d’analyse, de synthèse et de communication des résultats.
• Aptitudes à la formation, la communication et l’encadrement.

Diplômes, Formation, Expérience

• Diplôme réglementaire : Doctorat, diplôme d’ingénieur.

• Domaines de formation souhaités : biophysique, physique, (bio)-informatique, biochimie et biologie.
• Une expérience approfondie en microscopie électronique en transmission, de préférence cryo, est requise.
• Une expérience sur une plate-forme d'imagerie et/ou au sein d’une équipe de recherche & développement adossée à une plate-forme d’imagerie est un plus.
• Une bonne compréhension de la physique des méthodes d'imagerie est indispensable pour évoluer dans un contexte de microscopie multimodale.
• Une expérience de la préparation des échantillons, principalement les échantillons congelés-hydratés pour la cryo-microscopie est souhaitée.
• Le candidat devra aussi maîtriser en spécialiste au moins une partie des principaux logiciels dédiés à l’acquisition, au traitement et à l’analyse des données en cryo-microscopie (SerialEM, DigitalMicrograph, IMOD/Etomo, EMAN2, RELION, CryoSparc, MATLAB, Python, ImageJ).

Tendances d’évolution, Facteur d’évolution à moyen terme

• Développement d’expérimentation scientifique de haute technologie.
• Développement du travail collaboratif avec les autres modalités présentes au sein du Centre d’Imagerie Multimodale – US43.
• Mise en place de méthodes de microscopie corrélatives (photonique/électronique/ionique/X, …).

Toutes nos opportunités sont ouvertes à des personnes en situation de handicap.

Informations sur le contrat

• Type de contrat : Contrat à durée déterminée de mission (Contrat à Objet Défini)
• Date de démarrage : Dès que possible
• Durée du contrat : 18 mois, renouvelable
• Temps de travail : à plein temps
• Rémunération : selon les grilles en vigueur
• Avantages : Restauration collective, prise en charge du titre de transport annuel à 70%, mutuelle d’entreprise
• Localisation du poste : Orsay
• Référence : 2023-04-U43-CDDIR01

Contact

Pour postuler, merci d’envoyer CV et lettre de motivation à Frédéric COQUELLE : frederic.coquelle@curie.fr.

Date de parution de l’offre : 24 avril2023

Date limite des candidatures : 25 mai 2023

L'Institut Curie est un employeur inclusif respectant l'égalité des chances.

Il s’engage également à appliquer des normes exigeantes en matière d'intégrité de la recherche.