Ingénieur en analyse d’image de microscopie (H/F)

Logo IC
Cette offre est expirée, il n’est plus possible de postuler
Date de clôture
Lieu(x) de travail
Paris
Secteur
Centre de Recherche
L'Institut Curie est un acteur majeur de la recherche et de la lutte contre le cancer. Il est constitué d'un hôpital et d'un Centre de recherche de plus de 1000 collaborateurs avec une forte représentativité internationale.
L’objectif du Centre de recherche de l’institut Curie est de développer la recherche fondamentale et d’utiliser les connaissances produites pour améliorer le diagnostic, le pronostic, la thérapeutique des cancers dans le cadre du continuum entre la recherche fondamentale et l’innovation au service du malade.

Description du poste

  • Laboratoire - Service

L'unité Génétique et Biologie du Développement (https://institut-curie.org/unit/umr3215-u934) de l'Institut Curie est un département multidisciplinaire qui, entre autres, étudie la dynamique des tissus de l'échelle de la cellule à celle de l'organe au cours du développement. Les équipes de recherche utilisent la microscopie optique à fluorescence pour visualiser en temps réel différents processus biologiques dans divers organoïdes et modèles animaux (drosophile, poisson zèbre et souris). Grâce au soutien du programme Labex (https://labex-deep.institut-curie.org/), nous recherchons un ingénieur en analyse d’image (Bio-Image Analyst) enthousiaste et orienté service.

Le candidat travaillera dans le service d'imagerie cellulaire et tissulaire (PICT) et collaborera avec les chercheurs du campus de Paris et d'ailleurs, en les aidant à développer des solutions pour l'analyse des images. Les projets iront de la conception de flux d'analyse d'images, au développement de scripts/macros/plugins personnalisés, jusqu'à des collaborations complètes où l'analyste s'occupe du projet du début à la fin et fournit les données analysées. Le candidat conseillera et enseignera également aux utilisateurs leurs stratégies d'analyse d'images.

  • Missions
    • Mise en œuvre d'outils d'analyse et de traitement d'images.
    • Construire et déployer des outils d'analyse sur mesure pour des projets nécessitant des développements spécifiques.
    • Développer des logiciels d'analyse d'images dont la portée dépasse les projets des utilisateurs.
    • Travailler avec des scientifiques pour écrire / implémenter des algorithmes pour résoudre des problèmes de traitement d'images à partir d'ensembles de données de microscopie à fluorescence multidimensionnelle.
    • Améliorer les outils existants (vitesse de calcul, interface utilisateur, création de workflow).
    • Validation des outils développés.
    • Former les scientifiques à l'utilisation des outils développés et réaliser des tutoriels.

 

Profil recherché

  • Formation et expérience

Le candidat doit être titulaire d'un diplôme d'ingénieur ou d'un master en (bio)informatique, (bio)physique, mathématiques appliquées ou tout autre domaine connexe, suivi d'une expérience professionnelle d'au moins 3 ans dans l'analyse de bioimages dans le cadre de la recherche ou du soutien à l'activité de recherche, ou titulaire d'un doctorat en analyse de bioimages, bio-informatique, (bio)physique, mathématiques appliquées ou tout autre domaine connexe.

  • Compétences et qualités requises
    • Mathématiques appliquées ou domaines connexes avec une connaissance approfondie de l'analyse d'images.
    • Savoir utiliser et optimiser les réseaux en apprentissage profond (Deep-learning).
    • Expérience du traitement d'images, de la visualisation de données et du développement de logiciels (par exemple Icy, Fiji/ImageJ, Napari).
    • Compétences en programmation (par exemple, Python, MATLAB, Java, C/C++).
    • Bonne connaissance des algorithmes de segmentation, du suivi des objets, de la reconnaissance des formes.
    • Une expérience en biologie et en imagerie serait un plus.
    • Aimer collaborer avec d'autres personnes sur leurs projets.
    • Capacité à travailler en équipe tout en gérant plusieurs projets simultanément avec un haut degré d'autonomie technique.
    • Capable de communiquer en anglais.

 

Informations sur le contrat

  • Type de contrat : CDD
  • Date de démarrage : dès que possible
  • Durée du contrat : 18 mois, renouvelable
  • Temps de travail : Temps complet
  • Rémunération : selon les grilles en vigueur
  • Avantages : Restauration collective, prise en charge du titre de transport annuel à 70%, mutuelle d’entreprise
  • Localisation du poste : Paris

 

Contact

Pour postuler, merci d’envoyer CV, lettre de motivation et contact de 2 références à Olivier Renaud (olivier.renaud@curie.fr).

 

Toutes nos opportunités sont ouvertes à des personnes en situation de handicap.

L'Institut Curie est un employeur inclusif respectant l'égalité des chances.

Il s’engage également à appliquer des normes exigeantes en matière d'intégrité de la recherche.

 

Date de parution de l'offre : 09 juin 2022

Exemple : +33112365489
Seuls les PDF sont acceptés.