Ingénieur en Analyse d’images et de données Image and Data Analyst (H/F)

Laboratoire – Service

Le poste est à pourvoir au sein de l'UMR 168 (CNRS/ Institut Curie/ SU), le département de Physique du Centre de Recherche de l’Institut Curie. Cette unité rassemble une communauté de physiciens et de biologistes qui développent des approches interdisciplinaires pour approfondir notre connaissance des mécanismes cellulaires et des pathologies liés à leurs dysfonctionnements. L'UMR168 est basée sur le campus parisien de l'Institut Curie. Elle compte 13 équipes de recherche et 2 services et ateliers communs, soit 150 personnes environ (1/3 permanents, 1/3 post-doctorants et 1/3 doctorants). L'ingénieur-e aura pour mission de créer un nouveau service commun pour accompagner les chercheurs de l'unité dans l'utilisation et le développement d'outils d'analyse, en particulier via les méthodes de deep learning.

Missions principales

L'ingénieur-e aura la charge d'accompagner les équipes de recherche du laboratoire sur leurs projets de recherche en mettant au point des méthodes d’analyse de données (« omics », « single cell »), d’analyse d’image (différentes méthodes d’imagerie du vivant) et en facilitant l’utilisation des méthodes récentes de machine learning au sein de ses équipes. Il mettra en place et maintiendra les ressources informatiques nécessaires à ces analyses (GPU, stockage, Cloud computing, etc…).

Activités principales :

·         Accompagner les projets scientifiques des chercheurs de l'unité autour de l'analyse des données.

·         Identifier et mettre en place les méthodes de machine learning appropriées pour analyser les données expérimentales des projets de recherche du laboratoire.

·         Mettre en place une base de données des modèles de machine learning et des datasets (images) produits par le laboratoire. Les valoriser au sein de l'unité et de nos partenaires.

·         Former et assurer le transfert technologique auprès des utilisateurs sur les différentes techniques utilisées.

·         Mettre en place et assurer le développement du service commun d'analyse de donnée du laboratoire

·         Accompagner les équipes dans l'achat et la maintenance de leurs équipements informatiques (GPU, ressources de calcul, stockage interne et externe).

·         Assurer le suivi des ressources de stockage et de calcul de l'unité.

·         Réaliser une veille scientifique et technique permanente et assister et / ou participer à des manifestations scientifiques.

·         Établir des liens étroits avec les autres laboratoires de l'Institut Curie et les laboratoires voisins (plateforme d’imagerie du Centre de Recherche, DSI, etc…)

·         Participer à l’animation du réseau d’analyse d’image de l’Institut Curie (Curie Vision).

Compétences :

·         Connaissances

o    Deep Learning avancé

o    Analyse d'image avancé (ImageJ, FiJi, Matlab, Python, Ilastik…)

o    Programmation (Python, C++, Java… ) avancé

o    Statistiques et analyse de donnée avancés

·         Compétences opérationnelles

o    Mettre en œuvre des solutions de deep learning pour l'analyse d'image

o    Utiliser les logiciels spécifiques à l'activité

o    Synthétiser et mettre en forme des résultats scientifiques (analyse de donnée)

o    Assurer la maintenance du matériel informatique associé à l'activité.

o    Rédiger des méthodes et des supports de formation.

o    Anglais Courant (oral et écrit)

·         Savoir-être

o    Pouvoir gérer de façon autonome l'organisation de son travail et s'adapter aux différents aspects des projets de recherche menés au laboratoire.

o    Être capable de travailler en équipe, être rigoureux et savoir être force de proposition.

o    Avoir d'excellentes qualités d'écoute et savoir transmettre son savoir-faire.

o    Goût pour l'interdisciplinarité et la biologie quantitative.

o    Curiosité scientifique et technique.

Informations sur le contrat

Type de contrat : contrat à durée déterminée

Niveau de diplôme : Master 2 ou Doctorat | Ingénieur-e en calcul scientifique

Date de démarrage : 1er novembre 2024

Durée du contrat :12 mois

Rémunération : selon les grilles en vigueur

Temps de travail : Temps complet

Avantages : Restauration collective, prise en charge du titre de transport, mutuelle d’entreprise

Localisation du poste : PARIS 5e

Référence : NA

Contact

Envoyer CV et lettre de motivation

Les entretiens auront lieu début Octobre 2024.

Date de parution de l’offre : 29 Août  2024

Date limite des candidatures : 15 Octobre 2024

L'Institut Curie est un employeur inclusif respectant l'égalité des chances.

Il s’engage également à appliquer des normes exigeantes en matière d'intégrité de la recherche.

https://euraxess.ec.europa.eu/sites/default/files/brochures/eur_21620_en-fr.pdf