Présentation
Cette dernière décennie a été marquée par l’émergence de nouvelles technologies de modification du génome. Publié en 2012, le système CRISPR/Cas9, qui a vu attribué le prix Nobel de Chimie aux chercheuses Emmanuelle Charpentier et Jennifer Doudna en 2020 permet, par sa grande flexibilité, l’inactivation individuelle de tous les gènes connus par coupure ciblée de l’ADN.
Créée en septembre 2017, la plateforme CRISPR’it utilise la technologie CRISPR/Cas9 afin de réaliser des cribles génétiques sur lignées cellulaires.
Les cribles génétiques sont de puissants outils permettant l’exploration de la fonction de l’ensemble des gènes du génome à travers la mutagénèse par le système CRISPR ou la modulation de l’expression des gènes par les systèmes CRISPRi (inhibition) et CRISPRa (activation)
Schéma d’un screen à venir
Parce que chaque projet est unique, la plateforme CRISPRit conseille les scientifiques dans leurs projets de criblage et supervise l’ensemble de la procédure de criblage, de la préparation des bibliothèques à l’analyse bio-informatique :
1- Préparation de la librairie (génomique ou personnalisée)
2- Production et titrage du virus
3- Infection des cellules cibles et préparation des banques de séquençage
4- Séquençage haut débit par la plateforme NGS
5- Analyse bio-informatique
Collaborations
La plateforme CRISPR’it travaille en étroite collaboration avec la plateforme NGS et la plateforme de Bio-informatique de l’Institut Curie tout au long du projet de criblage afin d’identifier les gènes candidats.