Criblage génétique sur la lignée cellulaire

La plateforme CRISPR’it vous accompagne dans le design et la mise en place de votre screen génétique sur lignée cellulaire à façon :

• Criblage positif ou négatif
  • Les cribles positifs permettent d’identifier les gènes dont la mutation, la baisse d’expression ou la surexpression, confère un avantage prolifératif en réponse à une pression sélective (en présence de molécules thérapeutiques par exemple). Ce type de crible est particulièrement utilisé pour étudier les mécanismes de résistance aux traitements. Il peut aussi être utile pour l’étude de différents processus cellulaires lorsqu’une pression de sélection robuste est possible (par exemple, la sélection par antibiotique ou par cytométrie en flux).
  • Les cribles négatifs permettent d’identifier les gènes essentiels à la survie ou à la prolifération dans des conditions définies. Ce genre de crible est le plus souvent utilisé pour identifier des gènes essentiels dans un contexte particulier (par exemple, identification de létalités synthétiques).

• Librairie Genome-Wide (GW) ou customisée
  • La plateforme utilise plusieurs librairie GW commercialement disponibles sur Addgene (Sabatini, Brunello, Weissman, Calabrese, etc)
  • Nous offrons également la possibilité de cloner des librairies restreintes dans le cadre de screen secondaire lorsqu’une définition préalable des potentiels gènes candidats est possible

• Criblage inactivation (CRISPR-KO), inhibition (CRISPRi) ou inactivation (CRISPRa)
  • Utilisation de la SpCas9 sauvage afin de réaliser des inactivations de gènes (KO)
  • dCas9-KRAB pour l’inactivation transcriptionnelle de gènes
  • dCas9-VPR pour l’activation transcriptionnelle de gènes

En parallèle des screens dit « classiques » mentionnés ci-dessus, la plateforme a une activité de R&D (voir onglet suivant) et peut s’adapter si vous avez des demandes spécifiques.

• La plateforme CRISPR’it est membre du réseau européen Core For Life, qui regroupe les plateformes technologiques de grands instituts européens visant notamment à faciliter le partage d’expertise et la veille technologique.