Smart-seq3

La technologie Smart-seq3 combine une couverture du transcriptome entier avec une stratégie de comptage d'ARN qui permet la reconstruction in silico de milliers de molécules d'ARN entiers par cellule. Grâce à la couverture intégrale du transcriptome, Smart-seq3 permet par exemple la résolution des allèles, ainsi que l'identification des isoformes d'épissage et des variants génétiques. Smart-seq3 affiche une sensibilité nettement accrue par rapport au Smart-seq2 et détectera généralement des milliers de gènes supplémentaires par cellule. Comparé aux solutions 10X Genomics, nous détectons deux fois plus de gènes par cellule et trois fois plus de nouvelles jonctions avec le Smart-seq3, sur une lignée cellulaire de cancer du sein.

La technologie est particulièrement adaptée à de faibles nombres de cellules (à partir d’une centaine de cellules).