Le nouveau serveur web FoldScript, exploitant le meilleur des modèles AlphaFold : cas de test des complexes protéiques IN:IN et RT:IN du HIV-1

Les programmes de modélisation 3D utilisant l'intelligence artificielle (IA) ont révolutionné la biologie structurale, permettant souvent de prédire les structures des protéines avec des niveaux de confiance sans précédent. Cependant, ces structures restent des modèles, et il est toujours intéressant de comparer les résultats de différents prédicteurs (Alphafold, Rosettafold, EMSfold...), de ne pas se limiter au modèle généré avec le score de confiance le plus élevé, et d'introduire des données expérimentales telles que les zones de contact intermoléculaires dans son choix. Nous avons créé un serveur web, nommé "FoldScript", pour répondre efficacement à ces différentes questions. Je présenterai ce nouveau serveur web lors de la conférence, montrant comment nous l'avons utilisé pour analyser des complexes protéiques étudiés par notre équipe, et comment FoldScript nous a fourni une aide rationnelle à la prise de décision.