Logiciel Genuage
Genuage
Genuage pour la visualisation et l'analyse de données multidimensionnelles en nuages de points
La microscopie à localisation de molécules uniques (SMLM) devient la méthode de choix dans plusieurs études biologiques. La SMLM explore les structures et la composition cellulaires à l'échelle nanométrique. Le suivi de molécules uniques fournit également des informations précieuses sur l'interaction moléculaire.
De nouvelles méthodes optiques sont en cours de développement et la complexité des données enregistrées augmente. Cela soulève de nombreuses préoccupations concernant la représentation, l'interaction et l'analyse des données.
Genuage est un logiciel open-source dédié à la visualisation et à l'analyse de données multidimensionnelles en nuage de points.
Genuage propose deux modes de visualisation : (i) un mode bureau pour une visualisation simple des ensembles de données sur un écran 2D et (ii) un mode réalité virtuelle pour une expérience immersive à l'intérieur du nuage de points.
Les codes sources peuvent être trouvés ici :
https://github.com/Genuage/Genuage
les différentes versions :
https://github.com/Genuage/Genuage/releases
Consultez notre chaîne YouTube : https://www.youtube.com/channel/UC2Z1xaGfhUNkEqdHXiJwkAg/videos
Genuage est continuellement mis à jour avec des fonctionnalités croissantes.
Fonctionnalités actuelles :
Modes bureau et réalité virtuelle
Peut représenter : des ensembles de données à super-résolution en 2D et 3D, des trajectoires de particules uniques, des orientations moléculaires en 3D, multicolores.
Reconfiguration facile des paramètres visuels : réaffectation des colonnes, mise à l'échelle, taille des points, carte des couleurs...
Seuillage des données
Outils de sélection 3D
Plan de détourage à un angle arbitraire
Analyse des trajectoires
Calcul de densité
Interfaçable avec MATLAB et Python
Compatible avec les dlls définies par l'utilisateur
Personnes activement impliquées dans ce projet :
Thomas Blanc (Institut Curie), Mohamed El-Beheiry (Institut Curie et Institut Pasteur), Jean-Baptiste Masson (Institut Pasteur) et Bassam Hajj (Institut Curie).
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