Ingénieur bioinformatique en Thérapie Cellulaire (H/F)
Laboratoire - Service
Le poste est une collaboration entre l’équipe de Cécile Alanio (laboratoire d’Immunologie Clinique et d’Immunomonitoring), CellAction (Plateforme de Thérapie Cellulaire dirigée par Dr Marion Alcantara et Dr Sebastian Amigorena), et le laboratoire de Joshua Waterfall (Integrative Functional Cancer Genomics). Le/la candidat-e travaillera dans un environnement bioinformatique en étroite collaboration avec des biologistes et des cliniciens.
Missions
Les CAR T cell sont des traitements très efficaces dans les hémopathies. Leur application aux tumeurs solides est complexe. Notre travail est de mettre en place des études précliniques et postcliniques sur les CAR T pour améliorer les traitements cellulaires des patients avec tumeurs solides.
Nous cherchons un-e bioinformatician intéressé-e par la thérapie cellulaire pour rejoindre une équipe de cliniciens et d’immunologistes et appliquer des analyses de pointe sur des données cellules uniques transcriptomiques et épigénétiques. Ces données seront générées sur des échantillons de patients ou de souris, avant et après thérapie.
Description des activités
- Analyse de datasets transcriptomiques generes in house (scRNA-Seq, bulk RNASeq)
- Analyse de datasets épigénomiques (scATAC-Seq, CHIP-Seq)
- Exploration de database (GTEx, TCGA)
- Representation graphique des résultats scientifiques
Formation et expérience
- PhD en génomique computationelle ou M2 avec experience en recherche equivalente.
- Expérience en management et analyse de données genome-scale (RNAseq, scRNAseq)
- Expérience avec les outils bioinformatics et bio-statistics (R, python)
- Expérience avec les outils pipeline management (Nextflow, snakemake, kedro)
- Solide background en genomique computationelle appliquée à l’oncologie ou l’immunologie, et de préférence les deux
Compétences et qualités requises
- Capacité de travailler sur de larges computing clusters
- Autonomie et collaboration avec les biologistes
- Présentation et communication des résultats
- Bonne connaissance de l’anglais écrit et parlé
Toutes nos opportunités sont ouvertes à des personnes en situation de handicap.
Informations sur le contrat
Type de contrat : CDD
Date de démarrage : 1er Septembre 2024
Durée du contrat : 18 mois
Temps de travail : Temps complet
Rémunération : selon les grilles en vigueur
Avantages : Restauration collective, prise en charge du titre de transport annuel à 70%, mutuelle d’entreprise
Localisation du poste : Suresnes , puis Saint Cloud à partir de 2025- transports publics
Référence : NA
Contact
Pour postuler, merci d’envoyer CV et lettre de motivation
Date de parution de l’offre : 07 mai 2024
Date limite des candidatures : NA
L'Institut Curie est un employeur inclusif respectant l'égalité des chances.
Il s’engage également à appliquer des normes exigeantes en matière d'intégrité de la recherche.