Post-doctorat en Oncologie Computationnelle - Tumeurs cérébrales (F/H)

Laboratoire

L’équipe Cavalli recherche un.e chercheur.e post-doctorant.e pour étudier l’hétérogénéité au sein de tumeurs cérébrales.

Notre équipe développe ses travaux au sein de l’unité U1331 d’Oncologie computationnelle (INSERM, Mines ParisTech, Institut Curie) à l’Institut Curie. Ce département est composé de ~90 chercheurs et étudiants regroupés au sein d’équipes multidisciplinaires grandissantes composées de bioinformaticiens, biologistes, médecins, mathématiciens, statisticiens, physiciens et informaticiens (page unité U1331).

L’équipe Cavalli étudie l’hétérogénéité tumorale pour répondre à des questions cliniques importantes. Nous développons au sein du laboratoire des approches génomiques pour étudier différents aspects cliniques de la biologie des tumeurs cérébrales en analysant des données générées à partir d’échantillons de patients. Plus spécifiquement, nous étudions l’hétérogénéité intra-tumorale et spatiale, les interactions avec le microenvironnement, et l’évolution des gliomes et des tumeurs pédiatriques cérébrales. Nos projets sont développés dans un environnement dynamique et collaboratif avec les chercheurs et cliniciens de l’Institut Curie et nationaux /internationaux.

Projet de recherche

Nous recherchons un(e) chercheur(se) motivé(e) et talentueux(se) pour déchiffrer la complexité de la biologie tumorale et de l'hétérogénéité intra-tumorale de tumeurs cérébrales en réalisant des analyses computationnelles de données de séquençage de pointe. Il/Elle sera responsable de l'analyse de données multiomique single-nucleus RNA/ATAC-seq et de transcriptomique spatiale issues d'échantillons de patients ou de modèles de tumeurs cérébrales et travaillera en étroite collaboration avec les expérimentalistes.

Ce projet vise à décrypter la plasticité des cellules tumorales, notamment par l'évaluation et le développement de méthodes, ainsi que par l'interprétation biologique des résultats. Il/Elle réalisera également une étude comparative de modèles de tumeurs pédiatriques cérébrales inter-espèces en identifiant les programmes essentiels aux cellules tumorales. Enfin, il/elle étudiera le métabolome de gliomes IDH-mutés et réalisera une analyse d’intégration de données multiomique pour déchiffrer des mécanismes de résistance aux traitements de ces tumeurs.

Responsabilités

-       Développer et mener un projet de recherche ciblant l’hétérogénéité tumorale

-        Analyse complète de données (qualité, traitement, normalisation, résultats, visualisation, interprétation…) à partir de données brutes

-        Analyser des données single-nucleus RNA/ATAC-seq et de transcriptomique spatiale

-        Caractérisation du métabolome de tumeurs

-        Utilisation et développement de méthodes et de stratégies pour évaluer la plasticité des cellules tumorales

-        Analyse de données à grande échelle et intégration de différents types de données « omique »