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2024Epigenomic heterogeneity as a source of tumour evolutionNature Reviews Cancer
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2024Pervasive translation of Xrn1-sensitive unstable long non-coding RNAs in yeastRNA
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2023Multi-modal quantification of pathway activity with MAYANature Communications
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2022A POLD3/BLM dependent pathway handles DSBs in transcribed chromatin upon excessive RNA:DNA hybrid accumulationNature Communications
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2022Kronos scRT: a uniform framework for single-cell replication timing analysisNature Communications
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2022H3K27me3 conditions chemotolerance in triple-negative breast cancerNature Genetics
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MnM: a machine learning approach to detect replication states and genomic subpopulations for single-cell DNA replication timing disentanglement
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