Plateforme

CurieCoreTech - Génomique

Présentation

La plateforme de génomique est une plateforme de services dans le domaine de la génomique, ouverte à collaboration avec des équipes de divers horizons.

Depuis 2001, la plateforme met à disposition son savoir-faire, ses outils pour faciliter les analyses moléculaires portant sur l’ADN, l’ARN selon les besoins des équipes, les spécificités des échantillons de départ, les analyses à mener.

La plateforme propose son expertise et ses services dans le domaine de la génomique. Grace à une équipe ouverte et dynamique, la plateforme facilite la mise en œuvre d'analyses génomiques, veille à appliquer les approches les plus adaptées aux demandes, à délivrer les résultats contrôlés, les plus exhaustifs possibles et dans les meilleurs délais.  

La plateforme de génomique dispose d’outils technologiques à moyen et haut débit pour analyser la structure du génome, l’expression et la régulation de gènes, dans divers organismes, modèles cellulaires et tissus sains et pathologiques (tumeurs ou autres).  

La plateforme de génomique a acquis un savoir-faire dans l’analyse d’échantillons précieux et complexes, utile à l’évolution des pratiques d’analyses génomiques. De ce fait, la plateforme participe aux caractérisations moléculaires d’échantillons frais, congelés, ou fixés. 

La plateforme analyse des échantillons dans le cadre d’essais cliniques, dans le domaine du cancer et des maladies rares, et ainsi participe à l’établissement de signatures moléculaires, qui permettent d’améliorer le suivi et le traitement du patient. Elle est d’ailleurs une plateforme de secours européenne pour les tests Prosigna (typage moléculaire de cancers du sein). 

La plateforme participe également à des projets internationaux et à des collaborations avec des partenaires publics et privés. Une récente collaboration avec Prédilife, société développant des solutions innovantes de prédiction de risque de pathologies, a permis la mise en œuvre de tests génétiques de nouvelle génération pour la prédiction du risque de cancer du sein (Test MammoRisk, Saghatchian M, et al. Breast Cancer Res Treat. 2022. doi: 10.1007/s10549-021-06445-8).  

De façon à proposer des analyses innovantes, la plateforme s’attache également à implémenter voire développer de nouvelles techniques pour répondre aux besoins. 

Les services actuels sont : 

  • Conseils en génomique 
  • Préparations d’échantillons (cryo-section, purification d’acides nucléiques) 
  • Contrôles qualités des acides nucléiques 
  • Analyses génomiques 
  • Analyses transcriptomiques ciblées (signatures moléculaires) 
  • Analyses de la régulation de l’expression des gènes, de la méthylation, de la conformation de la chromatine, etc. 

 

Publications clés

Vie d'équipe


Cartographie optique Bionano - 1 juin 2020
Système Saphyr
La cartographie optique d’ADN de très haut poids moléculaire, technologie Bionano, système Saphyr, a été mis en service en juin 2020.

Pour les dernières actualités, consulter la page “Nos pôles d’expertise/développements” 

Séquençage Nanopore - 1 janvier 2022
Système MinION
Le séquençage de longs fragments d’ADN génomique par la technologie Nanopore, système MinION, a été mis en service en janvier 2022 pour compléter nos services et fournir la séquence des variants structuraux identifiés par Bionano. Pour les dernières actualités, consulter la page “Nos pôles d’expertise/développements” 

Soutenance de thèse - 10 octobre 2022
David Gentien
Soutenance de thèse de David Gentien, à Paris, le 10/10/2022 : Etude de la régulation de l'expression génique par une approche multi-omique dans deux modèles de mélanome uvéal agressif. 

Meeting Core For Life - 20 mai 2022
Vienne, 19-20/05/2022
Présentation d’une procédure pour l’identification de variants structuraux par cartographie optique Bionano puis leur caractérisation par séquençage ciblé Nanopore (Thomas Chenegros, Audrey Rapinat, David Gentien)  

Premier symposium Bionano - 30 mai 2023
Institut Curie Paris , 30-31/05/2023

Séminaire Core For Life - 2 juin 2023
Zurich, 01-02/06/2023 
Présentation de l’évaluation de méthodes de préparation d’ADN de très haut poids moléculaire pour la cartographique optique et l’analyse d’échantillons complexes tels que les tumeurs pigmentées et les tumeurs du cortex (Emilie Henry, David Gentien)

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