To top
Équipe
OLIVIER SAULNIER
Génomique et Développement des cancers de l'enfant

Le cancer est la première cause de décès par maladie chez l’enfant. Les mécanismes d’initiation tumorale des cancers de l’adulte et de l’enfant sont très différents. Les cancers pédiatriques résultent souvent d'une dérégulation du développement normal causant ainsi un blocage de la différentiation cellulaire. En détournant ces processus du développement normal, les cellules cancéreuses passent inaperçues et gagnent du temps pour se développer sous forme de lésions pré-cancéreuses puis progresser ensuite en une tumeur.

Un des buts principaux de notre équipe est d'identifier ces mécanismes afin de retracer les origines développementales des tumeurs cérébrales pédiatriques en utilisant des technologies omiques unicellulaires ("Single-Cell") et des analyses de données à l’échelle du génome. Nous nous intéressons aussi à identifier les programmes transcriptionnels et post-transcriptionnels qui sont utilisés par les cellules cancéreuses, ceci dans le but d'exploiter ces vulnérabilités et de proposer de nouvelles stratégies pour traiter ces cancers mortels. Nous utilisons la bioinformatique et la génomique afin de comprendre quels sont les programmes qui agissent au cours du développement normal et d'utiliser cette connaissance pour étudier les mécanismes qui sont détournés par les cellules cancéreuses dans les cancers de l'enfant. Nos principales forces sont la biologie du cancer, la biologie computationnelle et la génomique.

Les applications spontanées sont les bienvenues pour un projet en bioinformatique merci de me contacter à olivier.saulnier@curie.fr

Publications clés
  • Failure of human rhombic lip differentiation underlies medulloblastoma formation
    Nature
    Liam D. Hendrikse, Parthiv Haldipur, Olivier Saulnier, Jake Millman, Alexandria H. Sjoboen, Anders W. Erickson, Winnie Ong, Victor Gordon, Ludivine Coudière-Morrison, Audrey L. Mercier, Mohammad Shokouhian, Raúl A. Suárez, Michelle Ly, Stephanie Borlase, David S. Scott, Maria C. Vladoiu, Hamza Farooq, Olga Sirbu, Takuma Nakashima, Shohei Nambu, Yusuke Funakoshi, Alec Bahcheli, J. Javier Diaz-Mejia, Joseph Golser, Kathleen Bach, Tram Phuong-Bao, Patryk Skowron, Evan Y. Wang, Sachin A. Kumar, Polina Balin, Abhirami Visvanathan, John J. Y. Lee, Ramy Ayoub, Xin Chen, Xiaodi Chen, Karen L. Mungall, Betty Luu, Pierre Bérubé, Yu C. Wang, Stefan M. Pfister, Seung-Ki Kim, Olivier Delattre, Franck Bourdeaut, François Doz, Julien Masliah-Planchon, Wieslawa A. Grajkowska, James Loukides, Peter Dirks, Michelle Fèvre-Montange, Anne Jouvet, Pim J. French, Johan M. Kros, Karel Zitterbart, Swneke D. Bailey, Charles G. Eberhart, Amulya A. N. Rao, Caterina Giannini, James M. Olson, Miklós Garami, Peter Hauser, Joanna J. Phillips, Young S. Ra, Carmen de Torres, Jaume Mora, Kay K. W. Li, Ho-Keung Ng, Wai S. Poon, Ian F. Pollack, Enrique López-Aguilar, G. Yancey Gillespie, Timothy E. Van Meter, Tomoko Shofuda, Rajeev Vibhakar, Reid C. Thompson, Michael K. Cooper, Joshua B. Rubin, Toshihiro Kumabe, Shin Jung, Boleslaw Lach, Achille Iolascon, Veronica Ferrucci, Pasqualino de Antonellis, Massimo Zollo, Giuseppe Cinalli, Shenandoah Robinson, Duncan S. Stearns, Erwin G. Van Meir, Paola Porrati, Gaetano Finocchiaro, Maura Massimino, Carlos G. Carlotti, Claudia C. Faria, Martine F. Roussel, Frederick Boop, Jennifer A. Chan, Kimberly A. Aldinger, Ferechte Razavi, Evelina Silvestri, Roger E. McLendon, Eric M. Thompson, Marc Ansari, Maria L. Garre, Fernando Chico, Pilar Eguía, Mario Pérezpeña, A. Sorana Morrissy, Florence M. G. Cavalli, Xiaochong Wu, Craig Daniels, Jeremy N. Rich, Steven J. M. Jones, Richard A. Moore, Marco A. Marra, Xi Huang, Jüri Reimand, Poul H. Sorensen, Robert J. Wechsler-Reya, William A. Weiss, Trevor J. Pugh, Livia Garzia, Claudia L. Kleinman, Lincoln D. Stein, Nada Jabado, David Malkin, Olivier Ayrault, Jeffrey A. Golden, David W. Ellison, Brad Doble, Vijay Ramaswamy, Tamra E. Werbowetski-Ogilvie, Hiromichi Suzuki, Kathleen J. Millen, Michael D. Taylor
  • Oncogenic chimeric transcription factors drive tumor-specific transcription, processing, and translation of silent genomic regions
    Molecular Cell
    Julien Vibert, Olivier Saulnier, Céline Collin, Floriane Petit, Kyra J.E. Borgman, Jérômine Vigneau, Maud Gautier, Sakina Zaidi, Gaëlle Pierron, Sarah Watson, Nadège Gruel, Clémence Hénon, Sophie Postel-Vinay, Marc Deloger, Virginie Raynal, Sylvain Baulande, Karine Laud-Duval, Véronique Hill, Sandrine Grossetête, Florent Dingli, Damarys Loew, Jacob Torrejon, Olivier Ayrault, Martin F. Orth, Thomas G.P. Grünewald, Didier Surdez, Antoine Coulon, Joshua J. Waterfall, Olivier Delattre
  • ERG transcription factors have a splicing regulatory function involving RBFOX2 that is altered in the EWS-FLI1 oncogenic fusion
    Nucleic Acids Research
    Olivier Saulnier, Katia Guedri-Idjouadiene, Marie-Ming Aynaud, Alina Chakraborty, Jonathan Bruyr, Joséphine Pineau, Tina O’Grady, Olivier Mirabeau, Sandrine Grossetête, Bartimée Galvan, Margaux Claes, Zahra Al Oula Hassoun, Benjamin Sadacca, Karine Laud, Sakina Zaïdi, Didier Surdez, Sylvain Baulande, Xavier Rambout, Franck Tirode, Martin Dutertre, Olivier Delattre, Franck Dequiedt
Toutes les publications