La recherche sur les cancers de primitif inconnu

La recherche clinique

Les essais cliniques dédiés aux cancers de primitif inconnu sont peu nombreux, car ces tumeurs sont très hétérogènes et il est difficile de proposer un nouveau traitement qui puisse avoir un intérêt pour tous les patients. Deux essais cliniques internationaux ont cependant montré le bénéfice de la caractérisation approfondie de la maladie sur le plan moléculaire pour guider le traitement des CaPI. Ces deux essais sont désormais fermés et il n’est plus possible d’y participer.

CUPISCO : Le but de cet essai était d’évaluer le bénéfice d’un traitement basé sur le ciblage d’une altération moléculaire par un traitement de thérapie ciblée pour la prise en charge des CaPI. L’essai CUPISCO a démontré que pour les patients dont la tumeur présente une altération pouvant être ciblée, la prescription d’une thérapie adaptée est plus efficace que la chimiothérapie. Cet essai démontre donc la nécessité de recherche systématiquement ces altérations ciblables dans les CaPI.

Essai Fudan CUP-001 : Le but de cet essai était d’évaluer le bénéfice d’une chimiothérapie orientée sur le tissu d’origine probable de la maladie (déterminé par un test moléculaire). Cet essai a démontré que chez les patients pour lesquels le test moléculaire était capable d’identifier l’origine tissulaire, la chimiothérapie « guidée » était plus efficace qu’une chimiothérapie large spectre. L’essai Fudan CUP-001 démontre l’intérêt des approches moléculaires visant à déterminer le tissu d’origine des CaPI, dont ceux utilisés en RCP nationale CaPI.

A ce jour, il n’y a pas d’essai clinique ouvert en France dédié aux patients atteints de CaPI. Cependant, certains essais cliniques ouverts à d’autres types de cancers peuvent être adaptés aux CaPI et peuvent être recommandés par la RCP nationale.

La recherche scientifique

Le groupe NET-CaPI est impliqué dans plusieurs projets de recherche visant à améliorer les connaissances sur la maladie et les modalités de prise en charge diagnostique et thérapeutique des cancers de primitif inconnu.

Le groupe a récemment développé l’outil d’intelligence artificielle TransCUPtomics, dédié à identifier le tissu d’origine des CaPI sur la base de leur profil moléculaire. Cet outil a été entrainé sur des profils moléculaires de plus de 20 000 échantillons de tumeurs et de tissus normaux et a appris à distinguer les « cartes d’identité moléculaires » de plusieurs centaines de sous-types différents de cancers.

Appliqué sur des profils moléculaires de CaPI, il permet de prédire l’origine de la maladie dans 70 à 80% des cas. Cet outil est disponible dans le cadre de la RCP nationale CUP, où les résultats prédits par l’IA sont intégrés par les médecins et scientifiques experts avec l’ensemble des autres caractéristiques de la maladie afin de rendre le diagnostic le plus précis possible.

De nouveaux outils d’intelligence artificielle basés sur l’utilisation de plusieurs types de données (images, données moléculaires) sont en cours de développement, pour en améliorer les performances.

D’autres projets de recherche sont menés par le groupe NET-CaPI et visent à étudier plus précisément certaines sous-entités de CaPI. Comme pour toutes les maladies rares, la collecte et l’analyse des données de patients est essentielle pour mieux connaitre la maladie et améliorer sa prise en charge. La RCP nationale est à l’origine de la constitution d’une base de données multimodale visant à favoriser le développement de projets de recherche. Le groupe a ainsi fourni la première caractérisation approfondie d’une cohorte de CaPI d’origine rénale présumée et identifiés dans le cadre de la RCP nationale CUP, et a pu démontrer l’intérêt d’un traitement basé sur cette origine rénale. D’autres projets sont actuellement en cours, notamment en collaboration avec l’IHU des cancers des femmes.