PHILIPPE HUPE

Docteur
Recherche - Paris
Spécialités / domaines
Bioinformatique,
Biostatistiques,
Cancer,
Centre de Recherche,
Développement de logiciel,
Génomique,
Intelligence artificielle,
Séquençage
Fonctions au sein de l'Institut Curie :
Présentation

Il a rejoint l'unité de bioinformatique en 2003 en tant qu'ingénieur de recherche. Il travaille sur des thématiques allant du développement d'algorithmes biostatistiques pour analyser des données à haut-débit, au développement d'un système d'information pour permettre l'interopérabilité des données biomédicales, et à l'ingénierie logiciel pour le calcul à haute-performance. En 2008, il a soutenu sa thèse de mathématiques à AgroParisTech sous la supervision de Jean-Jacques Daudin et Emmanuel Barillot. En 2010, il a été nommé directeur-adjoint de la plateforme de Bioinformatique de l'Institut Curie qu'il co-dirigie désormais avec Emmanuel Barillot et Nicolas Servant depuis 2019.

Publications
Microbe-host interplay in atopic dermatitis and psoriasis
Nature Communications
Nanna Fyhrquist, Gareth Muirhead, Stefanie Prast-Nielsen, Marine Jeanmougin, Peter Olah, Tiina Skoog, Gerome Jules-Clement, Micha Feld, Mauricio Barrientos-Somarribas, Hanna Sinkko, Ellen H. van den Bogaard, Patrick L.J.M. Zeeuwen, Gijs Rikken, Joost Schalkwijk, Hanna Niehues, Walter Däubener, Silvia Kathrin Eller, Helen Alexander, Davide Pennino, Sari Suomela, Ioannis Tessas, Emilia Lybeck, Anna M. Baran, Hamid Darban, Roopesh Singh Gangwar, Ulrich Gerstel, Katharina Jahn, Piia Karisola, Lee Yan, Britta Hansmann, Shintaro Katayama, Stephan Meller, Max Bylesjö, Philippe Hupé, Francesca Levi-Schaffer, Dario Greco, Annamari Ranki, Jens M. Schröder, Jonathan Barker, Juha Kere, Sophia Tsoka, Antti Lauerma, Vassili Soumelis, Frank O. Nestle, Bernhard Homey, Björn Andersson, Harri Alenius
Clinical and genetic landscape of treatment naive cervical cancer: Alterations in PIK3CA and in epigenetic modulators associated with sub-optimal outcome
EBioMedicine
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