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PHILIPPE HUPE
Docteur
Recherche - Paris
Spécialités / domaines
Bioinformatique,
Biostatistiques,
Cancer,
Centre de Recherche,
Développement de logiciel,
Génomique,
Intelligence artificielle,
Séquençage
Fonctions au sein de l'Institut Curie :
- Co-Directeur
Présentation
Il a rejoint l'unité de bioinformatique en 2003 en tant qu'ingénieur de recherche. Il travaille sur des thématiques allant du développement d'algorithmes biostatistiques pour analyser des données à haut-débit, au développement d'un système d'information pour permettre l'interopérabilité des données biomédicales, et à l'ingénierie logiciel pour le calcul à haute-performance. En 2008, il a soutenu sa thèse de mathématiques à AgroParisTech sous la supervision de Jean-Jacques Daudin et Emmanuel Barillot. En 2010, il a été nommé directeur-adjoint de la plateforme de Bioinformatique de l'Institut Curie qu'il co-dirigie désormais avec Emmanuel Barillot et Nicolas Servant depuis 2019.
Publications
Geniac: Automatic Configuration GENerator and Installer for nextflow pipelines
Open Research Europe
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Open Research Europe
Microbe-host interplay in atopic dermatitis and psoriasis
Nature Communications
Analytical Platforms 1: Use of Cultured Cells and Fluorescent Read-Out Coupled to NormaCurve Normalization in RPPA
Advances in Experimental Medicine and Biology