Analyses du génome

L'Institut Curie est une référence en matière d'analyse du génome et de technologie d'édition du génome, en combinant des approches transversales en physique, chimie et biologie. Cette offre est complétée par une forte expertise en bio-informatique, avec les équipements les plus avancés pour l'analyse des gènes.

Séquençage de nouvelle génération

La plateforme CurieCoreTech – Séquençage Haut-Débit (ICGEX) de l’Institut Curie offre un support technique et scientifique de premier plan pour l'analyse du génome dans le cadre de projets industriels. Cette plateforme maîtrise les techniques de séquençage haut-débit (NGS) et les services biostatistiques associés pour permettre la caractérisation moléculaire d'échantillons cliniques ou d'échantillons provenant de votre entreprise dans des délais très courts.

Informations clés :

• Conseils scientifiques pour trouver la technique adaptée à votre projet  
• Génome entier, exome entier et reséquençage ciblé
• Analyse du transcriptome (RNA-seq pour ARNm, ARN total et petit ARN)
• Épigénétique avec méthylation de l'ADN, ChIP-seq pour les modifications d'histones ou l'analyse de la liaison des protéines et les approches de capture de la conformation des chromosomes
• Séquençage de l'ARN en « single-cell »
• Séquençage à lecture longue
• Soutien bioinformatique

Génomique

La plateforme CurieCoreTech – Génomique de l’Institut Curie fournit aux projets de recherche industriels des outils technologiques à haut débit pour analyser la structure et l'expression des gènes dans divers organismes, modèles cellulaires et tumeurs en utilisant des approches de « Nanostring ».

Informations clés :

• Conception de votre plan expérimental
• Préparation des échantillons
• Analyse du génome (à l'échelle du génome, séquençage Sanger, etc.)
• Analyse du transcriptome : à l'échelle du génome, ou personnalisée jusqu'à 800 cibles
• Analyses du régulome : miARN et ARNnc, analysés à l'aide de matrices ou d'outils Nanostring, analyse de la méthylation (préparation de librairies OxBS), analyse de la conformation des chromosomes (HiC in situ).
• Support bioinformatique 

CRISPR'it

En utilisant la technologie CRISPR/Cas9 pour introduire des mutations sur tous les gènes connus, la plateforme Curie Core Tech –  Criblage génétique (CRISPR'it) de l’Institut Curie vous aidera à réaliser des criblages génétiques. Les cribles positifs sont généralement utilisés pour étudier les mécanismes de résistance aux médicaments dans les cellules cancéreuses. Les cribles à sélection négative visent à identifier les gènes qui sont essentiels à la survie ou à la prolifération dans des conditions définies.

Informations clés :

• Conception de votre plan expérimental
• Préparation de la bibliothèque (à l'échelle du génome ou personnalisée) et contrôle de la qualité
• Production et titrage du virus
• Infection des cellules cibles et préparation des librairies
• NGS par la plateforme de séquençage de nouvelle génération et contrôle de qualité
• Analyse bioinformatique

Bioinformatique

Depuis les dernières décennies, notre révolution technologique dans la lutte contre le cancer a conduit à une accumulation sans précédent de données provenant pour la plupart de nouveaux équipements.  Toutes les installations de l'Institut Curie bénéficient du soutien de la plateforme CurieCoreTech - Bioinformatique (CUBIC) nécessaire pour traiter ces quantités de données. La plateforme est composée d'une trentaine de bioinformaticiens, biostatisticiens et ingénieurs logiciels qui offrent une expertise multidisciplinaire pour soutenir les entreprises biotechnologiques dans leurs activités quotidiennes avec l'analyse des données obtenues à partir des technologies à haut débit. Les compétences vont de l'analyse statistique et de la gestion des données au développement de logiciels et au calcul à haute performance.

Informations clés :

• Collecte de données à partir de différentes sources, y compris, mais sans s'y limiter, la NGS, la spectrométrie de masse, la RPPA, le phénotypage cellulaire.
• Analyse des données bioinformatiques et biostatistiques
• Gestion des données
• Formation en bioinformatique et en biostatistique
• Conseils en bioinformatique et biostatistique
• Accès à l'informatique de haute performance
• Accès à des logiciels d'analyse internes et commerciaux