Équipe
Dynamique de la plasticité épigénétique dans le cancer
Présentation
Les modifications épigénétiques jouent un rôle crucial dans la progression des tumeurs, mais il reste un écart significatif dans notre compréhension par rapport aux altérations génétiques. Cette disparité est largement attribuée à la plasticité inhérente des changements épigénétiques. Contrairement aux mutations génétiques, qui sont stables et peuvent être facilement modélisées dans des systèmes cellulaires et animaux, induire des modifications épigénétiques spécifiques à des emplacements précis dans le génome représente un défi considérable. Aborder ces complexités est vital pour développer des stratégies thérapeutiques ciblées contre les cancers.
Notre équipe à l'Institut Curie, crée en 2017, se consacre à déchiffrer la dynamique des altérations épigénétiques au cours de la tumorigenèse. Nous visons à comprendre comment ces modifications évoluent dans le temps et comment elles se corrèlent avec les phénotypes tumoraux. Cette recherche est fondamentale pour envisager les changements épigénétiques comme des cibles thérapeutiques potentielles en oncologie.
Études en Laboratoire et Méthodologies
Notre laboratoire se concentre particulièrement sur les mécanismes non génétiques qui régissent l'évolution des tumeurs du sein lors des premières phases d'initiation tumorale et en réponse au traitement du cancer. Nous employons à la fois des approches expérimentales et informatiques pour cartographier les marques épigénomiques à une résolution unicellulaire. Cette cartographie à haute résolution nous permet d'étudier la dynamique des marques de chromatine dans des échantillons tumoraux, fournissant des informations sur la manière dont les tumeurs s'adaptent et évoluent.
Dans nos études récentes, nous avons combiné des approches épigénomiques et transcriptomiques unicellulaires avec des stratégies de traçage de lignées. Ce travail a révélé des événements épigénomiques initiaux responsables de la tolérance à la chimiothérapie dans le cancer du sein triple négatif. Nous avons notamment constaté que la marque d'histone répressive H3K27me3 agit comme un verrou essentiel à l'activation de programmes d'expression persistants dans les cellules cancéreuses du sein. Ces résultats ouvrent de nouvelles avenues pour des interventions thérapeutiques, suggérant que la combinaison de la chimiothérapie avec des inhibiteurs de déméthylase d'histone pourrait améliorer l'efficacité du traitement.
Expertise de l'Équipe
L'une des forces clés de notre équipe réside dans notre expertise multidisciplinaire, combinant une connaissance approfondie de la fouille de données et de la biologie moléculaire. Nous maîtrisons les analyses bioinformatiques et statistiques, qui sont essentielles pour caractériser et modéliser les états épi-transcriptomiques. Notre laboratoire est reconnu dans le monde entier pour sa capacité à profiler les modifications des histones dans les tumeurs humaines à une résolution unicellulaire, notamment grâce à notre technique de ChIP-seq unicellulaire à haut débit.
L'équipe Vallot représente un effort collaboratif qui établit un pont entre l'épigénétique en laboratoire et la biologie computationnelle. Avec notre ensemble de compétences diversifiées et nos approches innovantes, nous visons à contribuer de manière significative à la compréhension des mécanismes épigénétiques dans le cancer. En étudiant la stabilité et la dynamique des altérations épigénétiques, nous espérons ouvrir la voie à de nouvelles stratégies thérapeutiques pouvant améliorer les résultats des patients dans le cancer du sein et au-delà.
L'équipe est certifiée SiRIC ( Integrated Cancer Research Site ) et soutenue par le programme ATIP – Avenir, un ERC Starting Grant et récipiendaire de 9 prix nationaux pour l'innovation en recherche, et nous participons régulièrement à des événements scientifiques internationaux (ex. Gordon Conferences , EMBO, ESMO).
France Culture: show “Scientific Method” 2021
Céline Vallot – Epimedications
CNRS: Bronze Medal 2018
Céline Vallot – Bronze Medal CNRS 2018
France Culture: program “Scientific Method” 2017
Céline Vallot – epigenetics report
