Dynamique de la plasticité épigénétique dans le cancer

Pour comprendre les aberrations épigénétiques dans la progression tumorale, il n'existe que peu de modèles cellulaires ou animaux, par rapport aux altérations génétiques. Cet écart est dû en grande partie à la plasticité des modifications épigénétiques. Induire une modification épigénétique souhaitée à un endroit donné du génome reste un défi. Dans l'équipe, nous cherchons à comprendre la dynamique d'acquisition des altérations épigénétiques au cours de la tumorigenèse, à évaluer leur stabilité dans le temps et à caractériser leur lien avec le phénotype tumoral. Ces questions sont des préalables à l’utilisation de ces altérations comme cibles thérapeutiques.

Les études en laboratoire se concentrent sur les mécanismes non génétiques de l'évolution des tumeurs du sein au cours des premières phases de l'initiation de la tumeur et en réponse et en résistance au traitement du cancer. Nous développons des approches expérimentales et informatiques pour cartographier les marques épigénomiques à une résolution unicellulaire, permettant d'étudier la dynamique des marques chromatiniennes dans des échantillons de tumeurs (Grosselin et al. Nat Genet 2019 ; Prompsy et al. Nat Comm 2020). Sur nos derniers résultats, nous avons combiné des approches épigénomiques et transcriptomiques unicellulaires aux stratégies de traçage de la lignée pour révéler les événements épigénomiques initiaux à l'origine de la tolérance à la chimiothérapie dans le cancer du sein triple négatif (Marsolier & Prompsy et al., Nat Genet 2022), démontrant que le système répressif La marque d'histone H3K27me3 est un verrou pour l'activation d'un programme d'expression persistant dans les cancers du sein, ouvrant la voie à une justification thérapeutique pour combiner la chimiothérapie avec des inhibiteurs d'histone déméthylase.

L’une des forces de notre équipe est de posséder une expertise approfondie tant en fouille de données qu’en biologie moléculaire. Nous développons des analyses bioinformatiques et statistiques pour caractériser et modéliser les états épi-transcriptomiques rencontrés. Notre laboratoire possède une expertise en épigénétique du cancer et en technologie épigénomique unicellulaire. Nous sommes reconnus dans le monde entier pour notre capacité à profiler les modifications des histones dans les tumeurs humaines avec une résolution unicellulaire, en utilisant sa technique ChIP-seq unicellulaire à haut débit.
L'équipe Vallot a été créée à l'Institut Curie en 2017 et rassemble à la fois des spécialistes de laboratoire humide en épigénétique et des informaticiens pour constituer une équipe pluridisciplinaire de 12 personnes.

L'équipe est certifiée SiRIC ( Integrated Cancer Research Site ) et soutenue par le programme ATIP – Avenir, un ERC Starting Grant et récipiendaire de 9 prix nationaux pour l'innovation en recherche, et nous participons régulièrement à des événements scientifiques internationaux (ex. Gordon Conferences , EMBO, ESMO).

France Culture: show “Scientific Method”  2021 
Céline Vallot – Epimedications

CNRS: Bronze Medal 2018 
Céline Vallot – Bronze Medal CNRS 2018

France Culture: program “Scientific Method” 2017 
Céline Vallot – epigenetics report